Aquí os dejo un scriptillo muy resultón para escanear documentos de una o varías páginas y guardar el resultado directamente en PDF.
Ingredientes
python-imaging-sane
pdfjam
pysane
El script toma como único parámetro el nombre del fichero PDF resultante y se pone a escanear la primera página inmediatamente al arrancar. Después pregunta por consola si hay que escanear más páginas. Por último monta un PDF con todas las páginas escaneadas.