Si tienes Debian sid y has actualizado hace poco probablemente pdflatex ha empezado a fallar:

$ pdflatex main.tex
This is pdfTeX, Version 3.1415926-2.4-1.40.13 (TeX Live 2012/Debian)

kpathsea: Running mktexfmt pdflatex.fmt
I can't find the format file `pdflatex.fmt'!

Hay un bug abierto sobre esto: #709164

La solución según este hilo es instalar una versión antigua de libkpathsea6, por ejemplo:

http://ftp.de.debian.org/debian/pool/main/t/texlive-bin/libkpathsea6_2012.20120628-4_amd64.deb



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